邁克爾-斯科菲爾德(Michael　　Scofield)終于逃出了索納(Sona)監(jiān)獄，他隨即展開了一場復仇行動。在劇中，他給某人寫了一封信，在信中他警告說他將會讓公司(The　　Company)為他們的所作所為付出代價。“今天就是你們的祭日，”斯科菲爾德在信中寫到。在洛杉磯，他眼見著格雷奇恩(Gretchen)和惠斯勒(Whistler)從一輛由馬洪(Mahone)駕駛的豪華轎車中鉆出來，并且進入了羅斯福飯店。在喬裝打扮成一個侍者后，邁克爾走向了這群奪走了他一切的混蛋們。隨后，惠斯勒跟一個男人做了筆5千萬美元的買賣，而買賣的對象則是一枚對公司有著非比尋常價值的計算機存儲卡，拿到卡以后惠斯勒便殺了可憐的賣方。在惠斯勒正準備逃走之際，一直尾隨的邁克爾出面制服了他。在格雷奇恩進來查看到底發(fā)生了什么的時候邁克爾用槍瞄準了她，她告訴他說薩拉(Sara)仍然活著。在警察趕到的時候，三個人跑出了旅店。但是在邁克爾問出薩拉下落之前其他倆人卻早已逃之夭夭了。格雷奇恩與她的一名上司在沙漠中會面了，他告訴她說這枚存儲卡其實是個復制品。他從車上招來了殺手懷亞特(Wyatt)，但格雷奇恩隨即跟他做了筆交易保全了她的小命。邁克爾打來電話的時候林肯(Lincoln)，索菲亞(Sofia)，和LJ三人依然在巴拿馬。林肯告訴邁克爾說索納監(jiān)獄在一場騷亂之中給燒成了平地。T-Bag,　　蘇克雷(Sucre)，和貝里克(Bellick)三人下落不明。邁克爾拒絕跟他的親人見面，因為他得找出關(guān)于薩拉的真相。邁克爾接到一條來自Goldfinch.net的信息，對方稱他知道有關(guān)薩拉的事情。當他趕到會面地點的時候，他發(fā)現(xiàn)這個人其實是馬洪，而事實上則是惠斯勒想跟邁克爾談點事。惠斯勒讓邁克爾潛入一個安保措施嚴密的地點并且?guī)退愕侥菑埓鎯ǖ脑ｑR洪說格雷奇恩已經(jīng)死了，惠斯勒對邁克爾說薩拉現(xiàn)在在芝加哥并且身處險境。這時懷亞特現(xiàn)身了，并且沖著正在說話的惠斯勒的腦門送了顆子彈。在邁克爾和馬洪尋找掩體的時候，懷亞特從惠斯勒的口袋里搜出了那張存儲卡。T-Bag在睡過了Lechero的前女友，也就是索納監(jiān)獄里的“修女”之后便去投奔邁克爾了。同時，身處巴拿馬的三人眾在一條小巷內(nèi)被一位疑似來自公司的男人給截住了。林肯一馬當先出手撂倒了他，隨后警察出現(xiàn)了，林肯隨即投降而另外兩人跑走了。另一方面，懷亞特闖入了馬洪的家并且挾持了他的妻子潘(Pam)，逼迫她說出他想要知道的事情。邁克爾準備打電話找薩拉的時候卻被認出他的警察打斷了。在警察局，他見到了國家安全局的特工唐-塞爾夫(Don　　Self)，他許諾在邁克爾拿到公司的存儲卡之后會給他自由，因為這張卡里有著公司不可告人的內(nèi)幕。馬洪回到家的時候卻被警察攔在門口，警察告訴他說如果他進去了，他一定會后悔的。不用說，潘的死相一定異常凄慘。蘇克雷和貝里克在一家醫(yī)院被警察逮到，當時蘇克雷正見他女兒第一面。唐讓邁克爾召集他所需的人手以便能完成這項行動，于是林肯，蘇克雷，貝里克和馬洪又跟他見面了。當眾人正準備商討有關(guān)行動的細節(jié)的時候，唐又告訴大家說布魯斯-本內(nèi)特(Bruce　　Bennett)保釋了所有人。他將邁克爾引到了薩拉所在之處，兩人立馬干柴烈火地激情擁抱。在單獨相處的時候，她給邁克爾看了她在公司遭受折磨時留下的疤痕，兩人正準備你儂我儂之時懷亞特又不識時務(wù)地持槍沖入了他們的房間。在逃跑的過程中他們落下了林肯。隨后邁克爾給唐打電話說他們同意做這單生意。看起來他們跟公司的恩恩怨怨又要糾葛不清了。